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测序




货号:CX01

规格:1个

计量单位:个

交货周期:现货

采购模板: DNA-Sequence

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DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分 是基于文献引用次数,影响因子,文献新近度等因素计算的客观产品评级,得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证,质量可信度越高

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产品说明书


产品说明书 DNA-Sequence


Sanger测序


擎科生物是采用以磁珠为依托的半自动测序流程。较传统膜纯化方法,采用磁珠方法大幅提高模板纯度和浓度,有效避免信号弱,信号衰减,甚至无信号的风险,测序成功率为国内领先水平。


服务特色


·         实验基地:全国多个城市都有实验基地,近距离的提供服务。

·         质量可靠:上下游实验均采用磁珠纯化,实验稳定结果更好。

·         快速交付:当日取样,最快次日上午发送结果。

·         测序通量:拥有二十多台3730xl测序仪,可满足大批量测序要求。


送样要求


菌液

1. 需培养的菌液:提供的量不少于200μl

2. 长途运输尽量提供穿刺菌;

3. 新鲜菌液易于培养,可以获得更多的DNA,同时更大限度保证菌种的纯度。

质粒

1. 请务必溶于灭菌的双蒸水中。

2. 检测浓度大于50 ng/μl浓度;不少于20μl

PCR产物

1. 已纯化的PCR请务必溶于灭菌的双蒸水中,不少于20μl

2. 未纯化的PCR不少于30μl

测序引物要求

1. 引物长度最好在20bp左右;

2. 引物浓度要≥5 pmol/μl,最少提供10μl,浓度为5 pmol/μl的引物一个反应需要1μl

3. 与扩增不同,正反引物需要单独分装提供,切勿混装。


订单注意事项

·         请详细填写测序样本登记表,避免产生问题订单,以便及时安排实验。

·         送样管上编号请和登记表上一致,样品编号可包含“字母”、“数字”、“—”,请勿出现其他特殊字符。

·         菌液样品需要注明使用抗生素。

·         若需要测序的引物不是通用引物,请单独提供,并标注浓度。

·         若测序样品存在特殊结构,请在订单上备注,如:GC rich、甲基化、复杂结构等。

·         大批量的样品,请提供电子版样品表格。


测序常见问题:

Q-1.测序结果有很多套峰,还照常收费,为什么?

A-1.DNA模板上出现二处以上引物结合位点,或者DNA模板上有严重的重复序列,以及测序引物不纯时, 测序结果便会出现套峰现象。出现这种现象的原因由DNA模板本身或者引物本身所造成,这些结果会收费。


Q-2.为什么用PCR产物测序时,经常会出现套峰现象?

A-2.PCR产物测序出现套峰现象,一般有以下几种原因:

(1) PCR用模板不纯或PCR用引物特异性不好,扩增出的产物除了目的片段外,还有与目的片段长度相近的片段,即使用凝胶电泳也无法分离开,这样的PCR产物测序结果是套峰。

(2) 结构上的原因,造成了PCR产物测序出现套峰的现象。PolyA/T G/C以及原因不明的复杂结构的存在,都会出现测序结果套峰的情况。


Q-3.出现套峰的原因是什么?

A-3.在测序反应中,模板或引物的原因都可能造成套峰的形成,归结其形成原因有以下几点:

(1) 测序引物在模板上有两个结合位点形成套峰。

(2) 模板不纯,如果是质粒或是菌液,原因是非单克隆,如果是PCR,原因为非特异性条带。

(3) 模板序列的特殊结构,如poly结构、发卡结构等。

(4) 引物降解,引物不纯,或引物的特异性不好。


Q-4.测序结果不到800 Bases,还照常收费了,为什么?

A-4.如在DNA样品中的DNA序列分布匀称,没有复杂结构时,正常的测序反应能保证达到800 Bases以上。但有一些DNA样品立体结构复杂,造成聚合酶延伸反应终止,测序信号突然减弱或消失,或者测序结果出现套峰现象。出现这些现象的原因由DNA模板本身所造成。 对这些结果,公司会根据具体测序情况进行收费。出现这些情况的原因分析如下:

(1) G/C rich、G/C Cluster:这种情况一般表现为测序信号突然减弱或消失;

(2) A、T的连续结构:这种情况一般表现为AT连续结构后面的测序结果出现套峰。根据文献记载,原因在于聚合酶进行聚合反应时,由于AT的连续,聚合酶难以识别完整的每个AT,在某个AT的后面便开始进行AT连续结构以后序列的聚合反应(打滑现象),造成测序结果紊乱,出现套峰。出现这样的情况,建议反向测序。

(3) 原因不明的复杂结构,测序结果出现突然信号减弱或消失。从序列上看,DNA碱基排列并无特别异常。估计是DNA整体出现复杂结构,从某一位置开始聚合酶的聚合反应便无法进行。


Q-5.觉得你给我的结果完全不是我需要的序列?

A-5.出现这样的情况只有两种可能:

(1) 可能是空载体,没有装进去目的片段。

(2) 您的样品插入部分与您预期的不一致。我们无法判断测得的序列是否与您预期的结果一致,我们可以为您做的是,检查发送给您的测序结果与您提供来的样品是否一致。出现您这样的问题,我们常规的做法是进行验证实验。验证实验的方法是取您的原始菌液重新抽提质粒进行测序。验证实验如在可靠范围内结果与前次不同则说明我们前次的测序结果是有问题的,前次测序的费用免除;如结果仍然相同,那么说明前次测序的结果准确,则您还需要支付这一次测序的费用。


Q-6.测序结果的找不到引物序列?

A-6(1) 如果您提供的是PCR样品,在测序报告上找不到您的引物序列是正常的。这是因为测序反应是通过对被荧光标记的ddNTP的读取而获得基因序列的,而测序引物由于没 有荧光标记,因此自然在测序结果中就不会被识别。实际上不但测序引物无法识别,而且由于目前测序技术的局限性,紧靠测序引物一侧的3050bp通常也无法100%识别,如果需要验证这个区域的碱基序列或者测序引物本身的序列,就需要用另一侧引物进行反向测序。

(2) 您提供的是质粒或菌液样品,使用通用引物测序,找不到您的PCR引物可能是因为您的PCR引物距离载体的通用引物位点过近,由于测序反应在距离起始位点30-50bp内的结果可信度不高,因此会影响您正确读取您的PCR引物序列。


Q-7.我有一个长的片段,希望你们帮我测通,还有测通需要的时间。

A-7(1) 长度为1KbDNA模板需要两个测序反应,才有可能得到完整准确的读长,对于1.6kb以上的DNA片断,在两个反应后还需要设计合成测序引物,测序后拼接出全长,对于这些测序引物,我们将按碱基个数收取引物合成费用。

(2) 测通需要的时间。

a.如有预期片段的序列,可以一次做设计好引物做出实验方案, 3-5天发送结果;

b.如没有预期的序列,可以从两端设计引物,引物合成时间需要48小时,测序需要48小时。